實(shí)時(shí)熒光定量PCR（qPCR）與普通PCR的主要區(qū)別在于檢測和定量DNA的方式。在實(shí)時(shí)熒光定量PCR中，PCR反應(yīng)產(chǎn)生的DNA會(huì)與熒光探針結(jié)合，使熒光信號(hào)實(shí)時(shí)監(jiān)測到PCR反應(yīng)的進(jìn)行過程，從而可以在PCR反應(yīng)進(jìn)行過程中定量DNA的數(shù)量。而普通PCR只能在反應(yīng)結(jié)束后通過凝膠電泳等方法來檢測PCR產(chǎn)物，無法實(shí)時(shí)監(jiān)測PCR反應(yīng)的進(jìn)行過程。

另外，實(shí)時(shí)熒光定量PCR的靈敏度更高，能夠檢測到更低濃度的DNA，同時(shí)也更準(zhǔn)確和可靠，可以避免假陽性結(jié)果的發(fā)生。因此，實(shí)時(shí)熒光定量PCR在科研實(shí)驗(yàn)、臨床診斷等領(lǐng)域具有廣泛的應(yīng)用。